Dinas Pertanian, Ketahanan Pangan dan Perikanan Kabupaten Ponorogo terdiri dari 6 Bidang dan Sekretariat, yaitu:
- Sekretariat
- Sub Bagian Umum dan Kepegawaian
- Keuangan
- Penyusunan Program dan Pelaporan
- Bidang Ketahanan Pangan
- Ketersediaan dan Kerawanan Pangan
- Distribusi dan Cadangaan Pangan
- Penganekaragaman Konsumsi dan Keamanan Pangan
- Bidang Prasarana dan Sarana Pertanian
- Pengelolaan Lahan dan Irigasi Pertanian
- Pengelolaan Pupuk Pestisida dan Pembiayaan Pertanian
- Pengelolaan Alat, Mesin, dan Investasi Pertanian
- Bidang Tanaman Pangan dan Hortikultura
- Perbenihan dan Perlindungan Tanaman Pangan dan Hortikultura
- Produksi Tanaman Pangan dan Hortikultura
- Pengolahan dan Pemasaran Hasil Tanaman Pangan dan Hortikultura
- Bidang Perkebunan
- Perbenihan dan Perlindungan Perkebunan
- Produksi Perkebunan
- Pengolahan dan Pemasaran Hasil Perkebunan
- Bidang Peternakan, Kesehatan Hewan dan Perikanan
- Usaha dan Produksi Peternakan
- Usaha dan Produksi Perikanan
- Kesehatan Hewan dan Kesehatan Masyarakat Veteriner
- Bidang Penyuluhan
- Kelembagaan Penyuluhan
- Ketenagaan Penyuluhan
- Metode dan Informasi Penyuluhan